Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20517G3UVU6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20517G3UVU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20517G3UVU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms