Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccl26F8VQM2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccl26F8VQM2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccl26F8VQM2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccl26F8VQM2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccl26F8VQM2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccl26F8VQM2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms