Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arid4aF8VPQ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Arid4aF8VPQ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arid4aF8VPQ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Arid4aF8VPQ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arid4aF8VPQ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arid4aF8VPQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms