Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdh9F8VPK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh9F8VPK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcdh9F8VPK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh9F8VPK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms