Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dcdc2bF7BCK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dcdc2bF7BCK0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Dcdc2bF7BCK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcdc2bF7BCK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dcdc2bF7BCK0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Dcdc2bF7BCK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Dcdc2bF7BCK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dcdc2bF7BCK0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dcdc2bF7BCK0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dcdc2bF7BCK0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcdc2bF7BCK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms