Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21977F6U3N7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21977F6U3N7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21977F6U3N7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms