Protein–RNA interactions for Protein: F6R3J9

Gm8879, Predicted gene 8879, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8879F6R3J9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8879F6R3J9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8879F6R3J9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8879F6R3J9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8879F6R3J9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8879F6R3J9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8879F6R3J9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8879F6R3J9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms