Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm17669F6QL70 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm17669F6QL70 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm17669F6QL70 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm17669F6QL70 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17669F6QL70 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms