Protein–RNA interactions for Protein: E9QAI8

Gm3460, Predicted gene 3460, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3460E9QAI8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3460E9QAI8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3460E9QAI8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3460E9QAI8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3460E9QAI8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3460E9QAI8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3460E9QAI8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3460E9QAI8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3460E9QAI8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms