Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Phldb3E9QAF4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Phldb3E9QAF4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Phldb3E9QAF4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phldb3E9QAF4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Phldb3E9QAF4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Phldb3E9QAF4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms