Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ythdc1E9Q5K9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc1E9Q5K9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ythdc1E9Q5K9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ythdc1E9Q5K9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ythdc1E9Q5K9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms