Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930546C10RikE9Q4Y3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930546C10RikE9Q4Y3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms