Protein–RNA interactions for Protein: E9Q422

A530032D15Rik, RIKEN cDNA A530032D15Rik gene, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530032D15RikE9Q422 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A530032D15RikE9Q422 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
A530032D15RikE9Q422 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A530032D15RikE9Q422 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A530032D15RikE9Q422 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A530032D15RikE9Q422 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A530032D15RikE9Q422 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms