Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt90E9Q1Z0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt90E9Q1Z0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt90E9Q1Z0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms