Protein–RNA interactions for Protein: E9PX37

Krtap27-1, Keratin-associated protein 27-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap27-1E9PX37 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krtap27-1E9PX37 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krtap27-1E9PX37 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krtap27-1E9PX37 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krtap27-1E9PX37 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krtap27-1E9PX37 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krtap27-1E9PX37 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krtap27-1E9PX37 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krtap27-1E9PX37 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms