Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Rsf1E9PWW9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Rsf1E9PWW9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Rsf1E9PWW9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Rsf1E9PWW9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.15
Rsf1E9PWW9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
Rsf1E9PWW9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
Rsf1E9PWW9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Rsf1E9PWW9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Rsf1E9PWW9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Rsf1E9PWW9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Rsf1E9PWW9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Rsf1E9PWW9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Rsf1E9PWW9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Rsf1E9PWW9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Rsf1E9PWW9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC40.76■■■■■ 4.11
Rsf1E9PWW9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Rsf1E9PWW9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Rsf1E9PWW9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Rsf1E9PWW9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Rsf1E9PWW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Rsf1E9PWW9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Rsf1E9PWW9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
Rsf1E9PWW9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rsf1E9PWW9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rsf1E9PWW9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rsf1E9PWW9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms