Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim30dE9PWL0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim30dE9PWL0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim30dE9PWL0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim30dE9PWL0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms