Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm2956E9PVJ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm2956E9PVJ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm2956E9PVJ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm2956E9PVJ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm2956E9PVJ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm2956E9PVJ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm2956E9PVJ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2956E9PVJ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm2956E9PVJ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2956E9PVJ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm2956E9PVJ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2956E9PVJ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms