Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl3E0CZ16 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl3E0CZ16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl3E0CZ16 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Klhl3E0CZ16 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl3E0CZ16 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl3E0CZ16 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl3E0CZ16 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms