Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc170D3YXL0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc170D3YXL0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc170D3YXL0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc170D3YXL0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc170D3YXL0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms