Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930444P10RikD3YUR1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930444P10RikD3YUR1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930444P10RikD3YUR1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930444P10RikD3YUR1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930444P10RikD3YUR1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms