Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kpna7C0LLJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kpna7C0LLJ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kpna7C0LLJ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kpna7C0LLJ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kpna7C0LLJ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kpna7C0LLJ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms