Protein–RNA interactions for Protein: B2RY83

Hpse2, Inactive heparanase-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpse2B2RY83 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hpse2B2RY83 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hpse2B2RY83 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hpse2B2RY83 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hpse2B2RY83 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpse2B2RY83 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpse2B2RY83 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpse2B2RY83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpse2B2RY83 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpse2B2RY83 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpse2B2RY83 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpse2B2RY83 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms