Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usf3B2RUQ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usf3B2RUQ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usf3B2RUQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usf3B2RUQ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usf3B2RUQ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usf3B2RUQ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usf3B2RUQ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usf3B2RUQ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usf3B2RUQ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usf3B2RUQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usf3B2RUQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms