Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BC035947B2RQY6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC035947B2RQY6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BC035947B2RQY6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC035947B2RQY6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC035947B2RQY6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms