Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp40B1B1D3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp40B1B1D3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp40B1B1D3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfp40B1B1D3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp40B1B1D3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms