Protein–RNA interactions for Protein: B1B034

Gm15155, Predicted gene 15155, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15155B1B034 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm15155B1B034 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm15155B1B034 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm15155B1B034 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm15155B1B034 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm15155B1B034 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms