Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf25B1AWN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf25B1AWN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfrsf25B1AWN9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf25B1AWN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms