Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930402K13RikB1AW18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930402K13RikB1AW18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
4930402K13RikB1AW18 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930402K13RikB1AW18 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930402K13RikB1AW18 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930402K13RikB1AW18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
4930402K13RikB1AW18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
4930402K13RikB1AW18 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms