Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprsB0V2N1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprsB0V2N1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprsB0V2N1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprsB0V2N1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprsB0V2N1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprsB0V2N1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms