Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930435E12RikA6X8Z9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930435E12RikA6X8Z9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930435E12RikA6X8Z9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930435E12RikA6X8Z9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930435E12RikA6X8Z9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms