Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samt1A2BED8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samt1A2BED8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samt1A2BED8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samt1A2BED8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms