Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2dnl2A2AFH2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2dnl2A2AFH2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2dnl2A2AFH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ube2dnl2A2AFH2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ube2dnl2A2AFH2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms