Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a3A2ACT7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col9a3A2ACT7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col9a3A2ACT7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col9a3A2ACT7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col9a3A2ACT7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms