Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Myom3A2ABU4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Myom3A2ABU4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Myom3A2ABU4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Myom3A2ABU4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myom3A2ABU4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Myom3A2ABU4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Myom3A2ABU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Myom3A2ABU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Myom3A2ABU4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Myom3A2ABU4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Myom3A2ABU4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Myom3A2ABU4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Myom3A2ABU4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Myom3A2ABU4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Myom3A2ABU4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Myom3A2ABU4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Myom3A2ABU4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Myom3A2ABU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms