Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms