Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef6A2A8M8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef6A2A8M8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef6A2A8M8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef6A2A8M8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef6A2A8M8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms