Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2l1A2A259 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2l1A2A259 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkd2l1A2A259 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkd2l1A2A259 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd2l1A2A259 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.8 ms