Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trav12-2A0N8N6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trav12-2A0N8N6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trav12-2A0N8N6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trav12-2A0N8N6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trav12-2A0N8N6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav12-2A0N8N6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms