Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU1

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDU1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A286YDU1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A286YDU1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A286YDU1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A286YDU1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A286YDU1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A286YDU1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A286YDU1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A286YDU1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A286YDU1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A286YDU1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A0A286YDU1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A286YDU1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A286YDU1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A286YDU1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A286YDU1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A286YDU1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A286YDU1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A286YDU1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A286YDU1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
A0A286YDU1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A286YDU1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A286YDU1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms