Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms