Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ighv1-42A0A0A6YY38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ighv1-42A0A0A6YY38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ighv1-42A0A0A6YY38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv1-42A0A0A6YY38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ighv1-42A0A0A6YY38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ighv1-42A0A0A6YY38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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