Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms