Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv23A0A0A6YWQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv23A0A0A6YWQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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