Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx6Q9ER75 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx6Q9ER75 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms