Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm5cP41230 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms