Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol9aQ8VDU3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apol9aQ8VDU3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms