Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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