Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col9a3A2ACT7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms