Protein–RNA interactions for Protein: Q8K215

Lyrm4, LYR motif-containing protein 4, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm4Q8K215 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lyrm4Q8K215 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms