Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arcn1Q5XJY5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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